Genes asociados a la respuesta a estrés hídrico en chile piquín: Búsqueda In silico

Solanácea

Interés

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Objetivo General

• Determinar la presencia de genes en Capsicum annuum var. glabriusculum asociados a reacciones producidas por estrés hídrico.

Objetivos Específicos

• Identificar gen(es) asociado(s) a la respuesta a estrés hídrico por medio de literatura.
• Determinar la presencia dicho(s) gen(es) en el genoma de Capsicum annuum var. glabriusculum.

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• Relacionar efectos del estrés hídrico en Capsicum annuum var. glabriusculum con la presencia de gen(es) asociados, a manera de perspectiva

Hipótesis

Al menos uno de los genes asociados a estrés hídrico reportados en otras plantas, está presente en el genoma de Capsicum annuum var. glabriusculum.

Justificación

Estrés hídrico

Secuenciación del genoma completo

Marco teórico

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Se han identificado

• nitrito reductasas
• cysteina sintetasas
• inhibidores de proteasas
• Polygalacturonasa

enzimas detoxicificantes, proteinasas, fosfolipasas y factores de transcripción

En C. annum

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• Descripción de histonas
• Enzima ascorbato oxidasa
• Capsidiol

Metodología

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• GNU wget
• ClustalX
• Bioedit
• BLAST - ncbi

Resultados

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